Utilisation de l’outil ADN environnemental : de l’échantillonnage à l’analyse bioinformatique.

Cette formation propose une introduction à l'outil d’ADN environnemental, depuis ses principes théoriques jusqu’à sa mise en œuvre pratique. La première journée est consacrée à la présentation de la technique (barcoding et metabarcoding), aux stratégies d’échantillonnage aquatique et terrestre (avec démonstration pratique), ainsi qu’au déroulement des analyses (extraction, PCR, préparation des librairies, séquençage et bioinformatique). Des cas d’études et une session d’interprétation des résultats complètent la journée.
La deuxième journée, orientée pratique, forme les participants à l’analyse bioinformatique des données de séquençage metabarcoding à l’aide des Obitools et du package metabaR, en travaillant sur un jeu de données fourni et accompagné par les formatrices.
Inscription possible sur 1 seul jour (sous conditions de compétences pour le jour 2, nous contacter)